Ennakkotilaajan etuna saat seuraavan sisällön: – Shoulder Baki (11) -lisävarustevariaatiota– Taisteluasujen erikoissetti -Audio-– Face Vision Seal -lisävaruste– Dream Catcher -lisävaruste.' Yuito ja Kasane ovat kaksi eliittikoulutettua psioniikkaa, joilla on aseita psykokineettisillä kyvyillä. Molemmilla on omat syynsä, miksi he ovat päättäneet olla mukana taistelussa tässä Brain Punk-tulevaisuudessa, jossa tekniikka kohtaa psykokineettiset kyvyt. Käy läpi heidän molemmat tarinansa, jotta voit avata tämän oudon tulevaisuuden kaikki salaisuudet. Kaukaisessa tulevaisuudessa ihmisaivoista löydetään psioninen hormoni, joka antaa ihmiselle yliaistillisia kykyjä ja muuttaa tuntemamme maailman. Juuri kun ihmiskunta oli astumassa uuteen aikakauteen, taivaalta alkoi laskeutua others-nimellä kutsuttuja raivokkaita mutantteja, jotka janoavat ihmisaivoja. Tavanomaiset hyökkäykset eivät tehonneet näihin ylivoimaisiin olentoihin, joten ihmiskunnan pelastamiseksi oli tartuttava äärimmäisiin keinoihin. Psionikoiksi kutsutut yliaistillisia kykyjä omaavat henkilöt olivat ainoa keino taistella yläilmoista lähestyvää vaaraa vastaan. Siitä päivästä lähtien ihmiskunnan viimeinen puolustuslinja Other Suppression Force (OSF) on etsinyt ja värvännyt yliluonnollisia kykyjä omaavia ihmisiä. Peli sisältää kaksi tarinaa, ja seikkailun voi aloittaa joko Yuito Sumeragilla, arvostetusta poliittisesta perheestä tulevalla tarmokkaalla tulokkaalla, tai Kasane Randallilla, salaperäisellä tiedustelijalla, jonka voimat ja kyvyt ovat saaneet huonon maineen OSF:ssä. SCARLET NEXUS -pelin teknologian ja psyykkisten kykyjen väliin jääneessä brainpunk-tulevaisuudessa koko tarinan ja mysteerit voi selvittää ainoastaan pelaamalla molemmilla hahmoilla, joiden tarinat nivoutuvat yhteen.